性功能障碍也有器质性原因,在诊断性功能障碍时必须排除有关的躯体疾病如性器官的慢性炎症,外伤以及相关的神经系统的病变。某些内分泌疾病,长期服用某些药物,患有精神疾病如抑郁症,焦虑性神经症都可能出现性功能障碍。