经济适用房分两种，经济适用房管理的房子，一般就是集资建房或者是回迁房，也就是常说的二类经济适用房，交易的时候买方出3%的土地出让金.另外一种就是经济适用房立项的房子，比如北京的回龙观,天通苑,通惠家园等等，批地的时候就是按照经济适用房审批的，这种房屋必须满5年才能交易，交易的时候要缴纳10%的综合地价款，
如果房本上面加盖了方形章，写着按经济适用房管理，那就是3%的土地出让金
商品房是不用交土地出让金的，回迁房里面可能会有一部分商品房，是因为原房主被拆迁的房子是私房，所以回迁后也不是按照回迁房给的，而是按照商品房处理的，所以商品房是不用交这个3%的，不过这种几率很小.